Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SOX6P35712 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOX6P35712 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOX6P35712 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOX6P35712 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOX6P35712 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX6P35712 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOX6P35712 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX6P35712 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SOX6P35712 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX6P35712 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX6P35712 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX6P35712 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SOX6P35712 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX6P35712 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOX6P35712 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX6P35712 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX6P35712 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX6P35712 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX6P35712 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX6P35712 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX6P35712 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX6P35712 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOX6P35712 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX6P35712 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX6P35712 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX6P35712 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOX6P35712 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOX6P35712 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOX6P35712 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX6P35712 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX6P35712 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX6P35712 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX6P35712 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX6P35712 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX6P35712 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX6P35712 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX6P35712 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX6P35712 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX6P35712 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX6P35712 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX6P35712 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX6P35712 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX6P35712 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX6P35712 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX6P35712 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOX6P35712 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX6P35712 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX6P35712 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SOX6P35712 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX6P35712 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX6P35712 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SOX6P35712 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX6P35712 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX6P35712 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX6P35712 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX6P35712 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX6P35712 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX6P35712 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX6P35712 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX6P35712 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX6P35712 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX6P35712 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX6P35712 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX6P35712 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX6P35712 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX6P35712 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX6P35712 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX6P35712 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX6P35712 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX6P35712 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX6P35712 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX6P35712 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX6P35712 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX6P35712 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX6P35712 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX6P35712 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX6P35712 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX6P35712 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX6P35712 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX6P35712 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX6P35712 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX6P35712 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX6P35712 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX6P35712 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX6P35712 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX6P35712 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX6P35712 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX6P35712 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX6P35712 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX6P35712 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX6P35712 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX6P35712 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX6P35712 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX6P35712 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOX6P35712 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX6P35712 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX6P35712 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX6P35712 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX6P35712 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms