Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms