Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA2P29317 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA2P29317 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA2P29317 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms