Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU1F1P28069 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU1F1P28069 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POU1F1P28069 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU1F1P28069 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU1F1P28069 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU1F1P28069 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU1F1P28069 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU1F1P28069 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU1F1P28069 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU1F1P28069 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms