Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC1P15941 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC1P15941 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MUC1P15941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MUC1P15941 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC1P15941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MUC1P15941 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC1P15941 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MUC1P15941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC1P15941 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC1P15941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC1P15941 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC1P15941 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC1P15941 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC1P15941 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC1P15941 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC1P15941 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC1P15941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC1P15941 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MUC1P15941 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC1P15941 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC1P15941 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC1P15941 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC1P15941 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC1P15941 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC1P15941 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC1P15941 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC1P15941 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC1P15941 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC1P15941 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC1P15941 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC1P15941 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC1P15941 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC1P15941 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MUC1P15941 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MUC1P15941 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MUC1P15941 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MUC1P15941 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MUC1P15941 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MUC1P15941 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MUC1P15941 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MUC1P15941 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MUC1P15941 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MUC1P15941 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MUC1P15941 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MUC1P15941 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MUC1P15941 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MUC1P15941 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MUC1P15941 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MUC1P15941 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MUC1P15941 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MUC1P15941 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MUC1P15941 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MUC1P15941 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MUC1P15941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MUC1P15941 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MUC1P15941 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MUC1P15941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MUC1P15941 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MUC1P15941 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MUC1P15941 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MUC1P15941 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MUC1P15941 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MUC1P15941 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MUC1P15941 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MUC1P15941 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MUC1P15941 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MUC1P15941 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MUC1P15941 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MUC1P15941 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MUC1P15941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MUC1P15941 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MUC1P15941 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MUC1P15941 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MUC1P15941 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MUC1P15941 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MUC1P15941 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MUC1P15941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MUC1P15941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MUC1P15941 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MUC1P15941 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MUC1P15941 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MUC1P15941 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MUC1P15941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MUC1P15941 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MUC1P15941 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MUC1P15941 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MUC1P15941 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MUC1P15941 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MUC1P15941 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MUC1P15941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MUC1P15941 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms