Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PYGBP11216 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PYGBP11216 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PYGBP11216 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PYGBP11216 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PYGBP11216 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PYGBP11216 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PYGBP11216 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PYGBP11216 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PYGBP11216 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PYGBP11216 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PYGBP11216 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PYGBP11216 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PYGBP11216 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PYGBP11216 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PYGBP11216 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PYGBP11216 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PYGBP11216 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PYGBP11216 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PYGBP11216 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PYGBP11216 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PYGBP11216 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PYGBP11216 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PYGBP11216 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PYGBP11216 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PYGBP11216 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PYGBP11216 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PYGBP11216 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PYGBP11216 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PYGBP11216 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PYGBP11216 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PYGBP11216 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PYGBP11216 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PYGBP11216 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PYGBP11216 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PYGBP11216 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PYGBP11216 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PYGBP11216 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PYGBP11216 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PYGBP11216 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PYGBP11216 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PYGBP11216 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PYGBP11216 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PYGBP11216 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PYGBP11216 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PYGBP11216 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PYGBP11216 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PYGBP11216 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PYGBP11216 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PYGBP11216 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PYGBP11216 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PYGBP11216 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PYGBP11216 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PYGBP11216 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PYGBP11216 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PYGBP11216 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PYGBP11216 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PYGBP11216 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PYGBP11216 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PYGBP11216 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PYGBP11216 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PYGBP11216 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PYGBP11216 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYGBP11216 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PYGBP11216 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PYGBP11216 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PYGBP11216 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYGBP11216 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYGBP11216 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYGBP11216 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYGBP11216 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYGBP11216 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYGBP11216 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYGBP11216 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYGBP11216 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYGBP11216 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PYGBP11216 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYGBP11216 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYGBP11216 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PYGBP11216 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PYGBP11216 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PYGBP11216 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PYGBP11216 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PYGBP11216 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYGBP11216 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYGBP11216 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYGBP11216 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYGBP11216 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYGBP11216 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYGBP11216 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYGBP11216 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYGBP11216 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms