Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGFRP08138 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGFRP08138 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGFRP08138 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NGFRP08138 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NGFRP08138 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NGFRP08138 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGFRP08138 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NGFRP08138 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGFRP08138 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NGFRP08138 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NGFRP08138 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NGFRP08138 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NGFRP08138 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NGFRP08138 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NGFRP08138 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NGFRP08138 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NGFRP08138 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NGFRP08138 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NGFRP08138 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NGFRP08138 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGFRP08138 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGFRP08138 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGFRP08138 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGFRP08138 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGFRP08138 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGFRP08138 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGFRP08138 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGFRP08138 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGFRP08138 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGFRP08138 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGFRP08138 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NGFRP08138 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGFRP08138 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGFRP08138 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGFRP08138 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGFRP08138 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NGFRP08138 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NGFRP08138 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGFRP08138 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGFRP08138 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGFRP08138 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGFRP08138 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGFRP08138 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGFRP08138 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGFRP08138 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGFRP08138 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGFRP08138 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGFRP08138 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NGFRP08138 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NGFRP08138 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NGFRP08138 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NGFRP08138 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NGFRP08138 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NGFRP08138 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NGFRP08138 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NGFRP08138 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NGFRP08138 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NGFRP08138 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NGFRP08138 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NGFRP08138 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NGFRP08138 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NGFRP08138 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NGFRP08138 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NGFRP08138 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NGFRP08138 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NGFRP08138 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NGFRP08138 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NGFRP08138 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NGFRP08138 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NGFRP08138 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NGFRP08138 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NGFRP08138 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NGFRP08138 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NGFRP08138 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NGFRP08138 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NGFRP08138 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NGFRP08138 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NGFRP08138 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NGFRP08138 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NGFRP08138 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NGFRP08138 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NGFRP08138 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NGFRP08138 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NGFRP08138 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NGFRP08138 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NGFRP08138 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NGFRP08138 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NGFRP08138 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NGFRP08138 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NGFRP08138 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NGFRP08138 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NGFRP08138 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NGFRP08138 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NGFRP08138 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NGFRP08138 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGFRP08138 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGFRP08138 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGFRP08138 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGFRP08138 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms