Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSTN1O94985 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN1O94985 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSTN1O94985 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN1O94985 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSTN1O94985 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN1O94985 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms