Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX3O75364 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX3O75364 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX3O75364 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX3O75364 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX3O75364 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX3O75364 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX3O75364 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX3O75364 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX3O75364 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX3O75364 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX3O75364 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX3O75364 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX3O75364 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX3O75364 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX3O75364 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX3O75364 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX3O75364 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX3O75364 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX3O75364 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX3O75364 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX3O75364 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX3O75364 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX3O75364 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX3O75364 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX3O75364 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX3O75364 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX3O75364 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX3O75364 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX3O75364 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX3O75364 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX3O75364 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX3O75364 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX3O75364 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX3O75364 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX3O75364 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX3O75364 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX3O75364 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX3O75364 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX3O75364 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX3O75364 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX3O75364 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX3O75364 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX3O75364 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX3O75364 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX3O75364 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITX3O75364 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITX3O75364 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX3O75364 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX3O75364 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITX3O75364 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX3O75364 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITX3O75364 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX3O75364 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX3O75364 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX3O75364 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX3O75364 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITX3O75364 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX3O75364 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITX3O75364 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX3O75364 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX3O75364 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX3O75364 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX3O75364 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX3O75364 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX3O75364 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITX3O75364 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX3O75364 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX3O75364 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX3O75364 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITX3O75364 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX3O75364 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX3O75364 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX3O75364 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITX3O75364 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITX3O75364 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX3O75364 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX3O75364 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX3O75364 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX3O75364 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX3O75364 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITX3O75364 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX3O75364 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITX3O75364 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PITX3O75364 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms