Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DCXO43602 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCXO43602 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCXO43602 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCXO43602 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCXO43602 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DCXO43602 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DCXO43602 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DCXO43602 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DCXO43602 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCXO43602 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCXO43602 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCXO43602 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCXO43602 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCXO43602 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCXO43602 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCXO43602 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCXO43602 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCXO43602 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCXO43602 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCXO43602 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCXO43602 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCXO43602 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCXO43602 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCXO43602 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCXO43602 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCXO43602 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DCXO43602 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCXO43602 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCXO43602 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCXO43602 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCXO43602 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCXO43602 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCXO43602 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCXO43602 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCXO43602 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCXO43602 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCXO43602 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DCXO43602 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCXO43602 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCXO43602 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCXO43602 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCXO43602 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCXO43602 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCXO43602 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCXO43602 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCXO43602 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DCXO43602 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCXO43602 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCXO43602 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCXO43602 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCXO43602 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCXO43602 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCXO43602 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCXO43602 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DCXO43602 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCXO43602 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCXO43602 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCXO43602 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCXO43602 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCXO43602 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCXO43602 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCXO43602 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCXO43602 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCXO43602 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCXO43602 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCXO43602 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCXO43602 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCXO43602 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCXO43602 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DCXO43602 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCXO43602 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCXO43602 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCXO43602 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCXO43602 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCXO43602 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCXO43602 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCXO43602 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCXO43602 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCXO43602 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCXO43602 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCXO43602 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCXO43602 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCXO43602 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCXO43602 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCXO43602 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCXO43602 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DCXO43602 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DCXO43602 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCXO43602 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DCXO43602 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCXO43602 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCXO43602 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCXO43602 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCXO43602 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCXO43602 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCXO43602 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCXO43602 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCXO43602 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCXO43602 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms