Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBDO15205 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBDO15205 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBDO15205 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBDO15205 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBDO15205 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBDO15205 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBDO15205 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBDO15205 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBDO15205 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBDO15205 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBDO15205 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBDO15205 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBDO15205 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBDO15205 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBDO15205 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBDO15205 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBDO15205 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBDO15205 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBDO15205 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBDO15205 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBDO15205 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBDO15205 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBDO15205 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBDO15205 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBDO15205 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBDO15205 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBDO15205 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBDO15205 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBDO15205 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBDO15205 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBDO15205 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBDO15205 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBDO15205 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBDO15205 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBDO15205 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBDO15205 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBDO15205 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBDO15205 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBDO15205 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBDO15205 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBDO15205 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBDO15205 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBDO15205 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBDO15205 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBDO15205 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBDO15205 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBDO15205 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBDO15205 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBDO15205 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBDO15205 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBDO15205 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBDO15205 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBDO15205 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBDO15205 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBDO15205 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBDO15205 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBDO15205 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBDO15205 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBDO15205 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBDO15205 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBDO15205 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBDO15205 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBDO15205 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBDO15205 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBDO15205 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBDO15205 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBDO15205 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBDO15205 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBDO15205 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBDO15205 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBDO15205 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBDO15205 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBDO15205 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBDO15205 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBDO15205 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBDO15205 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBDO15205 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBDO15205 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBDO15205 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBDO15205 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBDO15205 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBDO15205 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBDO15205 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBDO15205 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBDO15205 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBDO15205 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBDO15205 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBDO15205 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBDO15205 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBDO15205 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBDO15205 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms