Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VRH5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VRH5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VRH5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VRH5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VRH5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VRH5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VRH5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VRH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VRH5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VRH5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VRH5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VRH5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VRH5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VRH5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VRH5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VRH5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VRH5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VRH5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VRH5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VRH5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VRH5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VRH5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VRH5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VRH5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VRH5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VRH5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VRH5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VRH5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VRH5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VRH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
F8VRH5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8VRH5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
F8VRH5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8VRH5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8VRH5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8VRH5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8VRH5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8VRH5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
F8VRH5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8VRH5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8VRH5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8VRH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8VRH5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8VRH5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
F8VRH5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8VRH5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8VRH5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
F8VRH5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
F8VRH5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
F8VRH5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
F8VRH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F8VRH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
F8VRH5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F8VRH5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F8VRH5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F8VRH5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F8VRH5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
F8VRH5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F8VRH5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F8VRH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F8VRH5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
F8VRH5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
F8VRH5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
F8VRH5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
F8VRH5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
F8VRH5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
F8VRH5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
F8VRH5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms