Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBX1A6NMT0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DBX1A6NMT0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DBX1A6NMT0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DBX1A6NMT0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DBX1A6NMT0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms