Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN8A6NHC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN8A6NHC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN8A6NHC0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN8A6NHC0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN8A6NHC0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN8A6NHC0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN8A6NHC0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN8A6NHC0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms