Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2A0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2A0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2A0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J2A0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J2A0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J2A0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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