Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FXNQ16595 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FXNQ16595 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FXNQ16595 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FXNQ16595 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FXNQ16595 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FXNQ16595 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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