Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTR3CQ9C0K3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms