Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LSAMPQ13449 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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