Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms