Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms