Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 415.12■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP164-208ENST00000533153 585 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.09■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 514.74□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 514.74□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 514.26□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 BRD9-206ENST00000487688 753 ntTSL 514.23□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 414.05□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-217ENST00000524534 2441 ntTSL 513.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 513.12□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP164-203ENST00000525734 616 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.85□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-216ENST00000524481 3157 ntTSL 212.81□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 211.97□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 DENND5A-210ENST00000530044 4060 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 411.4□□□□□ -0.589e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NECTIN3-202ENST00000461477 586 ntTSL 410.93□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 TIMP2-202ENST00000536189 3415 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 410.01□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 DUSP16-205ENST00000541207 585 ntTSL 49.01□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-214ENST00000495748 746 ntTSL 58.7□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 DUSP16-203ENST00000536236 258 ntTSL 38.44□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NECTIN3-210ENST00000491525 564 ntTSL 48.25□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NECTIN3-208ENST00000486596 732 ntTSL 56.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 DUSP16-204ENST00000539940 566 ntTSL 46.27□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 MSH6-206ENST00000455383 578 ntTSL 521.43■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 319.81■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-208ENST00000493177 813 ntTSL 314.56□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 MSH6-211ENST00000606499 833 ntTSL 38.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)22.72■■□□□ 1.234e-8■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 221.57■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 GRAMD4-204ENST00000431155 311 ntTSL 333.64■■■□□ 2.989e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 SCARF1-207ENST00000573867 939 ntTSL 230.55■■■□□ 2.489e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 SUGP2-205ENST00000594445 732 ntTSL 328.15■■■□□ 2.14e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 GNA11-202ENST00000586180 739 ntTSL 327.42■■□□□ 1.989e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 327.35■■□□□ 1.974e-8■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.959e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.852e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.649e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH3-208ENST00000482460 557 ntTSL 325.31■■□□□ 1.649e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.589e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.539e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ASMTL-203ENST00000462195 573 ntTSL 224.44■■□□□ 1.59e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.459e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.49e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TRPM4-210ENST00000598691 594 ntTSL 522.72■■□□□ 1.239e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.229e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-215ENST00000592056 582 ntTSL 222.42■■□□□ 1.189e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.169e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.119e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 521.93■■□□□ 1.19e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.089e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 221.79■■□□□ 1.081e-12■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-206ENST00000460283 550 ntTSL 421.7■■□□□ 1.065e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.049e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NFKB2-205ENST00000467116 1634 ntTSL 221.49■■□□□ 1.039e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 GNA11-206ENST00000590534 2676 ntTSL 221.43■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ZNF148-208ENST00000495019 763 ntTSL 521.19■□□□□ 0.989e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.989e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.989e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 521.12■□□□□ 0.979e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.969e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 TNK2-209ENST00000430929 829 ntTSL 520.91■□□□□ 0.949e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.919e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 RNH1-213ENST00000528713 1202 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.919e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.889e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 KLC4-217ENST00000481499 1465 ntTSL 420.26■□□□□ 0.835e-9■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 PARVB-202ENST00000402876 560 ntTSL 1 (best)20.13■□□□□ 0.819e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 DAXX-205ENST00000446511 371 ntTSL 520.02■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 27.6
GTF2F1P35269 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 219.7■□□□□ 0.741e-12■■■■■ 27.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 199.1 ms