RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586180.1

GNA11-202, Transcript of G protein subunit alpha 11, humanhuman

TSL 3

Gene GNA11, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNA11-202ENST00000586180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.66■■■■■ 7.3
GNA11-202ENST00000586180 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.29■■■■■ 6.28
GNA11-202ENST00000586180 ABCC9O60706 1549 aa54.04■■■■■ 6.24
GNA11-202ENST00000586180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.5■■■■■ 5.84
GNA11-202ENST00000586180 NACADO15069 1562 aa51.22■■■■■ 5.79
GNA11-202ENST00000586180 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.05■■■■■ 5.76
GNA11-202ENST00000586180 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.58■■■■■ 5.69
GNA11-202ENST00000586180 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.54■■■■■ 5.68
GNA11-202ENST00000586180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.54■■■■■ 5.68
GNA11-202ENST00000586180 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.38■■■■■ 5.66
GNA11-202ENST00000586180 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.33■■■■■ 5.65
GNA11-202ENST00000586180 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.13■■■■■ 5.61
GNA11-202ENST00000586180 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.07■■■■■ 5.61
GNA11-202ENST00000586180 SCRIBQ14160 1630 aa49.55■■■■■ 5.52
GNA11-202ENST00000586180 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.26■■■■■ 5.48
GNA11-202ENST00000586180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.85■■■■■ 5.41
GNA11-202ENST00000586180 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
GNA11-202ENST00000586180 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.61■■■■■ 5.37
GNA11-202ENST00000586180 NCAPD3P42695 1498 aa47.3■■■■■ 5.16
GNA11-202ENST00000586180 SMARCA4P51532 1647 aa47.28■■■■■ 5.16
GNA11-202ENST00000586180 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.23■■■■■ 5.15
GNA11-202ENST00000586180 SMARCA2P51531 1590 aa47.05■■■■■ 5.12
GNA11-202ENST00000586180 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
GNA11-202ENST00000586180 HMGXB3Q12766 1538 aa46.96■■■■■ 5.11
GNA11-202ENST00000586180 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.8■■■■■ 5.08
GNA11-202ENST00000586180 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.79■■■■■ 5.08
GNA11-202ENST00000586180 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
GNA11-202ENST00000586180 NESP48681 1621 aa46.57■■■■■ 5.05
GNA11-202ENST00000586180 ERCC6Q03468 1493 aa46.55■■■■■ 5.04
GNA11-202ENST00000586180 CUX2O14529 1486 aa46.36■■■■■ 5.01
GNA11-202ENST00000586180 WIZO95785 1651 aa46.29■■■■■ 5
GNA11-202ENST00000586180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.18■■■■■ 4.98
GNA11-202ENST00000586180 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.05■■■■■ 4.96
GNA11-202ENST00000586180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
GNA11-202ENST00000586180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46■■■■■ 4.95
GNA11-202ENST00000586180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
GNA11-202ENST00000586180 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.86■■■■■ 4.93
GNA11-202ENST00000586180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.85■■■■■ 4.93
GNA11-202ENST00000586180 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
GNA11-202ENST00000586180 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.49■■■■■ 4.87
GNA11-202ENST00000586180 CFTRP13569 1480 aa45.42■■■■■ 4.86
GNA11-202ENST00000586180 WDR62O43379 1518 aa45.4■■■■■ 4.86
GNA11-202ENST00000586180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.36■■■■■ 4.85
GNA11-202ENST00000586180 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.36■■■■■ 4.85
GNA11-202ENST00000586180 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.15■■■■■ 4.82
GNA11-202ENST00000586180 PRDM2Q13029 1718 aa45.06■■■■■ 4.8
GNA11-202ENST00000586180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
GNA11-202ENST00000586180 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
GNA11-202ENST00000586180 TOPBP1Q92547 1522 aa44.56■■■■■ 4.72
GNA11-202ENST00000586180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
GNA11-202ENST00000586180 IFT140Q96RY7 1462 aa44.43■■■■■ 4.7
GNA11-202ENST00000586180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.41■■■■■ 4.7
GNA11-202ENST00000586180 ABCC8Q09428 1581 aa44.38■■■■■ 4.69
GNA11-202ENST00000586180 OSCARQ8IYS5 282 aa44.3■■■■■ 4.68
GNA11-202ENST00000586180 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
GNA11-202ENST00000586180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
GNA11-202ENST00000586180 TRIM41Q8WV44 630 aa44.17■■■■■ 4.66
GNA11-202ENST00000586180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
GNA11-202ENST00000586180 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.06■■■■■ 4.64
GNA11-202ENST00000586180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.01■■■■■ 4.64
GNA11-202ENST00000586180 CUX1P39880 1505 aa43.94■■■■■ 4.63
GNA11-202ENST00000586180 SOGA1O94964 1423 aa43.9■■■■■ 4.62
GNA11-202ENST00000586180 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.89■■■■■ 4.62
GNA11-202ENST00000586180 CHD1O14646 1710 aa43.85■■■■■ 4.61
GNA11-202ENST00000586180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
GNA11-202ENST00000586180 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
GNA11-202ENST00000586180 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
GNA11-202ENST00000586180 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
GNA11-202ENST00000586180 ARHGEF11O15085 1522 aa43.65■■■■■ 4.58
GNA11-202ENST00000586180 WDR97A6NE52 1622 aa43.63■■■■■ 4.58
GNA11-202ENST00000586180 FBLN2P98095 1184 aa43.63■■■■■ 4.57
GNA11-202ENST00000586180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.58■■■■■ 4.57
GNA11-202ENST00000586180 GRIN2BQ13224 1484 aa43.46■■■■■ 4.55
GNA11-202ENST00000586180 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
GNA11-202ENST00000586180 PBRM1Q86U86 1689 aa43.42■■■■■ 4.54
GNA11-202ENST00000586180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.38■■■■■ 4.54
GNA11-202ENST00000586180 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.38■■■■■ 4.53
GNA11-202ENST00000586180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.34■■■■■ 4.53
GNA11-202ENST00000586180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
GNA11-202ENST00000586180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.31■■■■■ 4.52
GNA11-202ENST00000586180 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.3■■■■■ 4.52
GNA11-202ENST00000586180 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.3■■■■■ 4.52
GNA11-202ENST00000586180 SYNJ1O43426 1573 aa43.29■■■■■ 4.52
GNA11-202ENST00000586180 SYNJ2O15056 1496 aa43.29■■■■■ 4.52
GNA11-202ENST00000586180 TOP2BQ02880 1626 aa43.28■■■■■ 4.52
GNA11-202ENST00000586180 ARAP1Q96P48 1450 aa43.27■■■■■ 4.52
GNA11-202ENST00000586180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.25■■■■■ 4.51
GNA11-202ENST00000586180 ADAMTS12P58397 1594 aa42.98■■■■■ 4.47
GNA11-202ENST00000586180 GRIN2AQ12879 1464 aa42.94■■■■■ 4.46
GNA11-202ENST00000586180 CEP170Q5SW79 1584 aa42.83■■■■■ 4.45
GNA11-202ENST00000586180 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.83■■■■■ 4.45
GNA11-202ENST00000586180 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.81■■■■■ 4.44
GNA11-202ENST00000586180 NUP160Q12769 1436 aa42.79■■■■■ 4.44
GNA11-202ENST00000586180 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.73■■■■■ 4.43
GNA11-202ENST00000586180 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
GNA11-202ENST00000586180 SHROOM2Q13796 1616 aa42.6■■■■■ 4.41
GNA11-202ENST00000586180 IGF1RP08069 1367 aa42.39■■■■■ 4.38
GNA11-202ENST00000586180 KIF27Q86VH2 1401 aa42.37■■■■■ 4.37
GNA11-202ENST00000586180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.37■■■■■ 4.37
GNA11-202ENST00000586180 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
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