Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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