Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP3AQ13472 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOP3AQ13472 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP3AQ13472 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP3AQ13472 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP3AQ13472 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP3AQ13472 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP3AQ13472 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP3AQ13472 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP3AQ13472 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP3AQ13472 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TOP3AQ13472 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP3AQ13472 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP3AQ13472 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP3AQ13472 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP3AQ13472 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP3AQ13472 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP3AQ13472 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP3AQ13472 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP3AQ13472 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP3AQ13472 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP3AQ13472 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP3AQ13472 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP3AQ13472 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP3AQ13472 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP3AQ13472 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP3AQ13472 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP3AQ13472 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP3AQ13472 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP3AQ13472 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOP3AQ13472 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP3AQ13472 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOP3AQ13472 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP3AQ13472 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP3AQ13472 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP3AQ13472 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOP3AQ13472 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP3AQ13472 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP3AQ13472 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP3AQ13472 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP3AQ13472 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP3AQ13472 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP3AQ13472 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP3AQ13472 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP3AQ13472 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP3AQ13472 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP3AQ13472 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP3AQ13472 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOP3AQ13472 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3AQ13472 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP3AQ13472 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP3AQ13472 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP3AQ13472 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP3AQ13472 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP3AQ13472 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP3AQ13472 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP3AQ13472 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP3AQ13472 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP3AQ13472 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP3AQ13472 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP3AQ13472 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP3AQ13472 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP3AQ13472 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP3AQ13472 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP3AQ13472 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP3AQ13472 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP3AQ13472 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP3AQ13472 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP3AQ13472 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP3AQ13472 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP3AQ13472 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP3AQ13472 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP3AQ13472 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP3AQ13472 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP3AQ13472 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP3AQ13472 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP3AQ13472 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP3AQ13472 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP3AQ13472 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP3AQ13472 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP3AQ13472 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP3AQ13472 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP3AQ13472 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP3AQ13472 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP3AQ13472 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP3AQ13472 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP3AQ13472 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP3AQ13472 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP3AQ13472 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOP3AQ13472 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP3AQ13472 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP3AQ13472 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP3AQ13472 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP3AQ13472 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TOP3AQ13472 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP3AQ13472 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP3AQ13472 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP3AQ13472 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP3AQ13472 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP3AQ13472 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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