Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 215.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.234e-10■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.384e-10■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 312.22□□□□□ -0.454e-10■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 FHIT-207ENST00000490952 1720 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.724e-10■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 CSNK1G3-204ENST00000508708 920 ntTSL 225.9■■□□□ 1.746e-7■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.446e-7■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.216e-7■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 SNTB1-205ENST00000520717 559 ntTSL 232.66■■■□□ 2.821e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 CDK19-208ENST00000497709 1117 ntTSL 316.82■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.25■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 27.9
GTF2F1P35269 THRB-210ENST00000447414 575 ntTSL 421.07■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THOC7-207ENST00000498422 738 ntTSL 320.33■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-204ENST00000413780 896 ntTSL 319.57■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-212ENST00000453729 703 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-207ENST00000418247 592 ntTSL 214.95□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THOC7-204ENST00000469584 836 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-208ENST00000428492 539 ntTSL 411.32□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-211ENST00000447875 754 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-209ENST00000431815 568 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THRB-205ENST00000415021 671 ntTSL 1 (best)6.97□□□□□ -1.293e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 THOC7-202ENST00000464327 459 ntTSL 56.83□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 MGAT1-207ENST00000504385 540 ntTSL 412.72□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 MGAT1-212ENST00000506708 745 ntTSL 29.84□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.523e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 GET4-207ENST00000483469 370 ntTSL 220.32■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 GET4-204ENST00000426056 502 ntTSL 411.61□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 311.48□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.329e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.329e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-215ENST00000523922 493 ntTSL 325.77■■□□□ 1.729e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.624e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.999e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-210ENST00000520454 488 ntTSL 320.81■□□□□ 0.929e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.759e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.369e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.029e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 NT5C1B-RDH14-202ENST00000532967 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 NT5C1B-RDH14-201ENST00000444297 1695 ntTSL 213.86□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 RDH14-202ENST00000468071 737 ntTSL 213.06□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-208ENST00000519916 597 ntTSL 210.97□□□□□ -0.659e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.289e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ZNF706-214ENST00000523146 476 ntTSL 53.94□□□□□ -1.789e-11■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 STARD8-204ENST00000488088 695 ntTSL 320.24■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 SLC2A1-AS1-201ENST00000416689 3075 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 SLC2A1-AS1-202ENST00000431759 1124 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-207ENST00000553964 2670 ntTSL 1 (best)23.06■■□□□ 1.283e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.183e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-215ENST00000557123 569 ntTSL 320.04■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-210ENST00000555132 554 ntTSL 420.04■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-208ENST00000553995 583 ntTSL 220.04■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-213ENST00000556757 588 ntTSL 220.04■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 518.74■□□□□ 0.593e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.323e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 CALM1-214ENST00000557020 557 ntTSL 413.87□□□□□ -0.193e-10■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 STARD8-205ENST00000523864 4864 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 27.8
GTF2F1P35269 ADGRL1-206ENST00000591528 612 ntTSL 213.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 LTBP4-206ENST00000546155 1285 ntTSL 222.25■■□□□ 1.154e-11■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.378e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.871e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.691e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP295NL-202ENST00000586713 711 ntAPPRIS P1 TSL 325.35■■□□□ 1.651e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.491e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-222ENST00000532751 563 ntTSL 423.92■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 DENND5A-205ENST00000526707 2861 ntTSL 222.25■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP164-202ENST00000525416 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.54■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 RPS23-202ENST00000503605 595 ntTSL 319.64■□□□□ 0.733e-14■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 AP000662.2-201ENST00000528466 567 ntTSL 419.15■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 RIN3-206ENST00000555589 2814 ntTSL 1 (best)19.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CERS4-202ENST00000557925 2401 ntTSL 518.86■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 PTPRK-208ENST00000392449 1456 ntTSL 218.76■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP295NL-203ENST00000587052 564 ntTSL 418.6■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP295NL-204ENST00000590267 582 ntTSL 218.6■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-225ENST00000522890 581 ntTSL 518.41■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 418.17■□□□□ 0.59e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 RPH3AL-217ENST00000575634 571 ntTSL 417.14■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 417.1■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 27.7
GTF2F1P35269 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 466 ms