RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.22■■■■■ 6.11
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.39■■■■■ 5.18
PTPRK-222ENST00000532751 ABCC9O60706 1549 aa46.28■■■■■ 5
PTPRK-222ENST00000532751 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.59■■■■■ 4.73
PTPRK-222ENST00000532751 NACADO15069 1562 aa44.52■■■■■ 4.72
PTPRK-222ENST00000532751 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.49■■■■■ 4.71
PTPRK-222ENST00000532751 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
PTPRK-222ENST00000532751 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.24■■■■■ 4.67
PTPRK-222ENST00000532751 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.05■■■■■ 4.64
PTPRK-222ENST00000532751 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.59■■■■■ 4.57
PTPRK-222ENST00000532751 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.22■■■■■ 4.51
PTPRK-222ENST00000532751 SCRIBQ14160 1630 aa43.2■■■■■ 4.51
PTPRK-222ENST00000532751 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.16■■■■■ 4.5
PTPRK-222ENST00000532751 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.77■■■■■ 4.44
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.38■■■■■ 4.37
PTPRK-222ENST00000532751 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
PTPRK-222ENST00000532751 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.9■■■■■ 4.3
PTPRK-222ENST00000532751 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.6■■■■■ 4.25
PTPRK-222ENST00000532751 SMARCA4P51532 1647 aa41.33■■■■■ 4.21
PTPRK-222ENST00000532751 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
PTPRK-222ENST00000532751 SMARCA2P51531 1590 aa41.07■■■■■ 4.16
PTPRK-222ENST00000532751 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.06■■■■■ 4.16
PTPRK-222ENST00000532751 NCAPD3P42695 1498 aa41.03■■■■■ 4.16
PTPRK-222ENST00000532751 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.99■■■■■ 4.15
PTPRK-222ENST00000532751 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.91■■■■■ 4.14
PTPRK-222ENST00000532751 HMGXB3Q12766 1538 aa40.88■■■■■ 4.13
PTPRK-222ENST00000532751 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
PTPRK-222ENST00000532751 WIZO95785 1651 aa40.6■■■■■ 4.09
PTPRK-222ENST00000532751 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
PTPRK-222ENST00000532751 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
PTPRK-222ENST00000532751 NESP48681 1621 aa40.03■■■■■ 4
PTPRK-222ENST00000532751 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.01■■■■■ 4
PTPRK-222ENST00000532751 ERCC6Q03468 1493 aa39.94■■■■□ 3.98
PTPRK-222ENST00000532751 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.85■■■■□ 3.97
PTPRK-222ENST00000532751 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.73■■■■□ 3.95
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.67■■■■□ 3.94
PTPRK-222ENST00000532751 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.64■■■■□ 3.94
PTPRK-222ENST00000532751 CFTRP13569 1480 aa39.61■■■■□ 3.93
PTPRK-222ENST00000532751 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
PTPRK-222ENST00000532751 CUX2O14529 1486 aa39.5■■■■□ 3.91
PTPRK-222ENST00000532751 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
PTPRK-222ENST00000532751 PRDM2Q13029 1718 aa39.44■■■■□ 3.9
PTPRK-222ENST00000532751 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.4■■■■□ 3.9
PTPRK-222ENST00000532751 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.37■■■■□ 3.89
PTPRK-222ENST00000532751 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.3■■■■□ 3.88
PTPRK-222ENST00000532751 WDR62O43379 1518 aa39.17■■■■□ 3.86
PTPRK-222ENST00000532751 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
PTPRK-222ENST00000532751 ABCC8Q09428 1581 aa38.82■■■■□ 3.81
PTPRK-222ENST00000532751 TOPBP1Q92547 1522 aa38.78■■■■□ 3.8
PTPRK-222ENST00000532751 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.76■■■■□ 3.8
PTPRK-222ENST00000532751 IFT140Q96RY7 1462 aa38.54■■■■□ 3.76
PTPRK-222ENST00000532751 CUX1P39880 1505 aa38.47■■■■□ 3.75
PTPRK-222ENST00000532751 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
PTPRK-222ENST00000532751 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.35■■■■□ 3.73
PTPRK-222ENST00000532751 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.72
PTPRK-222ENST00000532751 SOGA1O94964 1423 aa38.29■■■■□ 3.72
PTPRK-222ENST00000532751 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.26■■■■□ 3.72
PTPRK-222ENST00000532751 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.25■■■■□ 3.71
PTPRK-222ENST00000532751 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.22■■■■□ 3.71
PTPRK-222ENST00000532751 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.2■■■■□ 3.7
PTPRK-222ENST00000532751 TOP2BQ02880 1626 aa38.18■■■■□ 3.7
PTPRK-222ENST00000532751 SYNJ1O43426 1573 aa38.14■■■■□ 3.7
PTPRK-222ENST00000532751 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.699e-8■■■■■ 30.5
PTPRK-222ENST00000532751 WDR97A6NE52 1622 aa38.12■■■■□ 3.69
PTPRK-222ENST00000532751 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
PTPRK-222ENST00000532751 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.99■■■■□ 3.67
PTPRK-222ENST00000532751 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.86■■■■□ 3.65
PTPRK-222ENST00000532751 OSCARQ8IYS5 282 aa37.86■■■■□ 3.65
PTPRK-222ENST00000532751 GRIN2BQ13224 1484 aa37.85■■■■□ 3.65
PTPRK-222ENST00000532751 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.85■■■■□ 3.65
PTPRK-222ENST00000532751 PBRM1Q86U86 1689 aa37.84■■■■□ 3.65
PTPRK-222ENST00000532751 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.79■■■■□ 3.64
PTPRK-222ENST00000532751 CHD1O14646 1710 aa37.78■■■■□ 3.64
PTPRK-222ENST00000532751 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
PTPRK-222ENST00000532751 FBLN2P98095 1184 aa37.7■■■■□ 3.63
PTPRK-222ENST00000532751 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
PTPRK-222ENST00000532751 SYNJ2O15056 1496 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPRK-222ENST00000532751 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.56■■■■□ 3.6
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS12P58397 1594 aa37.49■■■■□ 3.59
PTPRK-222ENST00000532751 KIF27Q86VH2 1401 aa37.47■■■■□ 3.59
PTPRK-222ENST00000532751 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.42■■■■□ 3.58
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM41Q8WV44 630 aa37.37■■■■□ 3.57
PTPRK-222ENST00000532751 GRIN2AQ12879 1464 aa37.36■■■■□ 3.57
PTPRK-222ENST00000532751 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.31■■■■□ 3.56
PTPRK-222ENST00000532751 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.26■■■■□ 3.56
PTPRK-222ENST00000532751 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.26■■■■□ 3.56
PTPRK-222ENST00000532751 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.26■■■■□ 3.56
PTPRK-222ENST00000532751 CUL7Q14999 1698 aa37.26■■■■□ 3.56
PTPRK-222ENST00000532751 IGF1RP08069 1367 aa37.26■■■■□ 3.55
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGEF11O15085 1522 aa37.24■■■■□ 3.55
PTPRK-222ENST00000532751 NUP160Q12769 1436 aa37.18■■■■□ 3.54
PTPRK-222ENST00000532751 CEP170Q5SW79 1584 aa37.17■■■■□ 3.54
PTPRK-222ENST00000532751 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.08■■■■□ 3.53
PTPRK-222ENST00000532751 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.06■■■■□ 3.52
PTPRK-222ENST00000532751 SHROOM2Q13796 1616 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPRK-222ENST00000532751 ARAP1Q96P48 1450 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPRK-222ENST00000532751 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.88■■■■□ 3.49
PTPRK-222ENST00000532751 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.88■■■■□ 3.49
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