Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBNO1A3KN83 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBNO1A3KN83 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms