Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVOPQ8N4V2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms