Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC18A2Q05940 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms