Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNL1Q9UK58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms