Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX1-2Q9UD57 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX1-2Q9UD57 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms