Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5SQ99766 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5SQ99766 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms