Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms