Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMUB2Q71RG4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMUB2Q71RG4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms