Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG1Q06432 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282 ms