Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC01549A6NIU2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC01549A6NIU2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms