Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-8Q9BYQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms