Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-206ENST00000557822 545 ntTSL 418.06■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-210ENST00000559343 577 ntTSL 413.54□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-207ENST00000558234 3910 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-212ENST00000560004 544 ntTSL 412.13□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-205ENST00000551975 749 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-204ENST00000561662 482 ntTSL 321.3■■□□□ 14e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-218ENST00000567377 461 ntTSL 320.08■□□□□ 0.814e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-208ENST00000563220 1897 ntTSL 219.53■□□□□ 0.724e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-213ENST00000565834 1671 ntTSL 519.43■□□□□ 0.74e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-222ENST00000568034 1085 ntTSL 519.27■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-215ENST00000566843 2284 ntTSL 218.99■□□□□ 0.634e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-220ENST00000567720 544 ntTSL 418.67■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-224ENST00000568877 770 ntTSL 217.87■□□□□ 0.454e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-206ENST00000562610 850 ntTSL 317.71■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-223ENST00000568301 666 ntTSL 517.22■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-212ENST00000565517 536 ntTSL 416.87■□□□□ 0.294e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-210ENST00000564587 588 ntTSL 216.75■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-219ENST00000567399 976 ntTSL 516.36■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-216ENST00000567023 926 ntTSL 215.98■□□□□ 0.154e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-214ENST00000566230 490 ntTSL 315.46■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-209ENST00000564068 4204 nt14.88□□□□□ -0.034e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 PAX8-AS1-206ENST00000445745 2570 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 515.03■□□□□ -03e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NOL3-206ENST00000564992 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 222■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 NOL3-203ENST00000563439 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.58■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 NOL3-208ENST00000565645 519 ntTSL 419.88■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 NOL3-207ENST00000565560 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.259e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.239e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.869e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 CASP9-207ENST00000447522 954 ntTSL 320.23■□□□□ 0.839e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.79e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-234ENST00000566634 1540 ntTSL 518.27■□□□□ 0.519e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-208ENST00000562461 591 ntTSL 416.67■□□□□ 0.269e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.189e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 CASP9-208ENST00000469637 725 ntTSL 315.16■□□□□ 0.029e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-207ENST00000562228 734 ntTSL 314.41□□□□□ -0.19e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 523.64■■□□□ 1.379e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 SQSTM1-212ENST00000508284 578 ntTSL 420.07■□□□□ 0.89e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 SQSTM1-209ENST00000504627 602 ntTSL 520.07■□□□□ 0.89e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 SQSTM1-204ENST00000453046 572 ntTSL 420.07■□□□□ 0.89e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 SQSTM1-205ENST00000464493 532 ntTSL 415.72■□□□□ 0.119e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 SQSTM1-207ENST00000481335 562 ntTSL 413.56□□□□□ -0.249e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 SQSTM1-203ENST00000422245 628 ntTSL 412.99□□□□□ -0.339e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 320.36■□□□□ 0.854e-8■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 58.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 28.6
GTF2F1P35269 WDR1-209ENST00000505851 715 ntTSL 224.34■■□□□ 1.495e-7■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 WDR1-216ENST00000514319 719 ntTSL 515.44■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 514.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 ERI3-207ENST00000479101 367 ntTSL 314.58□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 ERI3-208ENST00000489710 394 ntTSL 310.59□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 ERI3-206ENST00000462341 320 ntTSL 35.85□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 216.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 PTPN12-216ENST00000523952 500 ntTSL 410.86□□□□□ -0.678e-20■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 417.97■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 28.5
GTF2F1P35269 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 TAB2-206ENST00000606202 648 ntTSL 45.86□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 23e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-202ENST00000579125 1318 ntTSL 1 (best)24.08■■□□□ 1.444e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.32e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-221ENST00000477707 581 ntTSL 423.11■■□□□ 1.296e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 TRADD-204ENST00000566104 669 ntTSL 222.18■■□□□ 1.143e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 12e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-203ENST00000593532 2380 ntTSL 220.51■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 218.79■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 318.02■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 28.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 631.8 ms