Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 TSPAN6-202ENST00000494424 820 ntTSL 26.07□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 SMCO4-203ENST00000526869 374 ntTSL 1 (best)22.03■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-206ENST00000496493 729 ntTSL 312.91□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-203ENST00000392218 763 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-208ENST00000543307 1003 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-204ENST00000392219 872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-211ENST00000590686 862 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-210ENST00000588699 927 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.122e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 FXYD5-213ENST00000592290 883 ntTSL 37.94□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.273e-16■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.263e-16■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 LAP3-208ENST00000512397 689 ntTSL 216.38■□□□□ 0.213e-16■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-16■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 LAP3-207ENST00000509583 887 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.533e-16■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 LAP3-206ENST00000508497 651 ntTSL 38.09□□□□□ -1.113e-16■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.045e-12■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 MMP11-207ENST00000465730 644 ntTSL 421.03■□□□□ 0.965e-12■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 MMP11-204ENST00000437086 2071 ntTSL 220.82■□□□□ 0.925e-12■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 MMP11-202ENST00000428253 537 ntTSL 418.67■□□□□ 0.585e-12■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 MMP11-208ENST00000477567 929 ntTSL 516.48■□□□□ 0.235e-12■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 MMP11-211ENST00000489582 593 ntTSL 415.95■□□□□ 0.145e-12■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 MMP11-206ENST00000465385 3823 ntTSL 214.7□□□□□ -0.065e-12■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.187e-7■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 RIMKLA-201ENST00000410070 864 ntTSL 322.64■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.879e-22■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.589e-22■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 NDUFS7-211ENST00000539882 555 ntTSL 418.22■□□□□ 0.515e-19■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 NDUFS7-206ENST00000535382 3050 ntTSL 215.34■□□□□ 0.051e-13■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-15■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-15■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 MRPL33-204ENST00000472192 238 ntTSL 310.44□□□□□ -0.745e-18■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 TSPAN6-203ENST00000496771 1025 ntTSL 319.99■□□□□ 0.792e-8■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.213e-10■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.813e-10■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 ABHD12-204ENST00000461204 712 ntTSL 322.72■■□□□ 1.233e-10■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 DDOST-205ENST00000477229 766 ntTSL 218.03■□□□□ 0.481e-21■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 DDOST-203ENST00000464364 502 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-21■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 C19orf70-202ENST00000585605 586 ntTSL 317.13■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.768e-7■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 SHISA5-203ENST00000417841 575 ntTSL 419.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 SHISA5-202ENST00000415268 556 ntTSL 418.07■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 SHISA5-205ENST00000424965 884 ntTSL 516.74■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 519.76■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 512.14□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.349e-17■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.369e-17■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-35■■■■■ 34.1
DDX3XO00571 CHAMP1-201ENST00000361283 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-10■■■■■ 34
DDX3XO00571 LSM10-203ENST00000489912 401 ntTSL 323.48■■□□□ 1.357e-15■■■■■ 34
DDX3XO00571 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.047e-15■■■■■ 34
DDX3XO00571 LSM10-202ENST00000476041 1006 ntTSL 314.23□□□□□ -0.137e-15■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-207ENST00000432789 1598 ntTSL 226.73■■□□□ 1.871e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.781e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-208ENST00000442616 553 ntTSL 524.82■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-206ENST00000431534 1464 ntTSL 521.72■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-209ENST00000483837 1829 ntTSL 518.86■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.93e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-202ENST00000411704 564 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-211ENST00000468923 1096 ntTSL 215.14■□□□□ 0.013e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-205ENST00000428425 2220 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.013e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-213ENST00000482976 669 ntTSL 213.53□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 NCBP2-209ENST00000463783 4161 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.943e-11■■■■■ 34
DDX3XO00571 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)25.9■■□□□ 1.741e-13■■■■■ 34
DDX3XO00571 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-13■■■■■ 34
DDX3XO00571 MGAT1-212ENST00000506708 745 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-20■■■■■ 34
DDX3XO00571 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.088e-8■■■■■ 34
DDX3XO00571 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.611e-10■■■■■ 34
DDX3XO00571 ZNF280B-202ENST00000619852 3981 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.971e-10■■■■■ 34
DDX3XO00571 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 34
DDX3XO00571 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 221.04■□□□□ 0.968e-8■■■■■ 34
DDX3XO00571 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.928e-8■■■■■ 34
DDX3XO00571 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 220.61■□□□□ 0.898e-8■■■■■ 34
DDX3XO00571 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 34
DDX3XO00571 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 34
DDX3XO00571 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 27.79□□□□□ -1.168e-8■■■■■ 34
DDX3XO00571 METTL7A-202ENST00000547104 1825 ntTSL 1 (best)14.04□□□□□ -0.164e-12■■■■■ 34
DDX3XO00571 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.94□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.152e-27■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 GLRX5-202ENST00000553672 912 ntTSL 28.71□□□□□ -1.022e-27■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.712e-11■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 NT5C1B-RDH14-201ENST00000444297 1695 ntTSL 213.75□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 RDH14-202ENST00000468071 737 ntTSL 212.67□□□□□ -0.382e-11■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 NT5C1B-RDH14-202ENST00000532967 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-11■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 33.9
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1548.9 ms