RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410070.6

RIMKLA-201, Transcript of ribosomal modification protein rimK like family member A, humanhuman

TSL 3

Gene RIMKLA, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLA-201ENST00000410070 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.47■■■■■ 6.79
RIMKLA-201ENST00000410070 ABCC9O60706 1549 aa51.64■■■■■ 5.86
RIMKLA-201ENST00000410070 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.58■■■■■ 5.85
RIMKLA-201ENST00000410070 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.12■■■■■ 5.45
RIMKLA-201ENST00000410070 NACADO15069 1562 aa48.81■■■■■ 5.4
RIMKLA-201ENST00000410070 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.7■■■■■ 5.39
RIMKLA-201ENST00000410070 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.34■■■■■ 5.33
RIMKLA-201ENST00000410070 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.22■■■■■ 5.31
RIMKLA-201ENST00000410070 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.07■■■■■ 5.29
RIMKLA-201ENST00000410070 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.02■■■■■ 5.28
RIMKLA-201ENST00000410070 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.81■■■■■ 5.24
RIMKLA-201ENST00000410070 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
RIMKLA-201ENST00000410070 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.53■■■■■ 5.2
RIMKLA-201ENST00000410070 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.15■■■■■ 5.14
RIMKLA-201ENST00000410070 SCRIBQ14160 1630 aa46.91■■■■■ 5.1
RIMKLA-201ENST00000410070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.68■■■■■ 5.06
RIMKLA-201ENST00000410070 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
RIMKLA-201ENST00000410070 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.57■■■■■ 5.04
RIMKLA-201ENST00000410070 NCAPD3P42695 1498 aa45.13■■■■■ 4.82
RIMKLA-201ENST00000410070 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.95■■■■■ 4.79
RIMKLA-201ENST00000410070 SMARCA4P51532 1647 aa44.82■■■■■ 4.77
RIMKLA-201ENST00000410070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.77■■■■■ 4.76
RIMKLA-201ENST00000410070 SMARCA2P51531 1590 aa44.75■■■■■ 4.75
RIMKLA-201ENST00000410070 HMGXB3Q12766 1538 aa44.74■■■■■ 4.75
RIMKLA-201ENST00000410070 CUX2O14529 1486 aa44.62■■■■■ 4.73
RIMKLA-201ENST00000410070 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.73
RIMKLA-201ENST00000410070 ERCC6Q03468 1493 aa44.53■■■■■ 4.72
RIMKLA-201ENST00000410070 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.48■■■■■ 4.71
RIMKLA-201ENST00000410070 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
RIMKLA-201ENST00000410070 NESP48681 1621 aa44.38■■■■■ 4.69
RIMKLA-201ENST00000410070 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.27■■■■■ 4.68
RIMKLA-201ENST00000410070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.05■■■■■ 4.64
RIMKLA-201ENST00000410070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
RIMKLA-201ENST00000410070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.79■■■■■ 4.6
RIMKLA-201ENST00000410070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.75■■■■■ 4.59
RIMKLA-201ENST00000410070 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.71■■■■■ 4.59
RIMKLA-201ENST00000410070 WIZO95785 1651 aa43.68■■■■■ 4.58
RIMKLA-201ENST00000410070 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.42■■■■■ 4.54
RIMKLA-201ENST00000410070 WDR62O43379 1518 aa43.36■■■■■ 4.53
RIMKLA-201ENST00000410070 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
RIMKLA-201ENST00000410070 CFTRP13569 1480 aa43.21■■■■■ 4.51
RIMKLA-201ENST00000410070 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.19■■■■■ 4.51
RIMKLA-201ENST00000410070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.17■■■■■ 4.5
RIMKLA-201ENST00000410070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
RIMKLA-201ENST00000410070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
RIMKLA-201ENST00000410070 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.69■■■■■ 4.42
RIMKLA-201ENST00000410070 PRDM2Q13029 1718 aa42.64■■■■■ 4.42
RIMKLA-201ENST00000410070 TRIM41Q8WV44 630 aa42.56■■■■■ 4.4
RIMKLA-201ENST00000410070 OSCARQ8IYS5 282 aa42.53■■■■■ 4.4
RIMKLA-201ENST00000410070 IFT140Q96RY7 1462 aa42.38■■■■■ 4.38
RIMKLA-201ENST00000410070 TOPBP1Q92547 1522 aa42.36■■■■■ 4.37
RIMKLA-201ENST00000410070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
RIMKLA-201ENST00000410070 ABCC8Q09428 1581 aa42.25■■■■■ 4.35
RIMKLA-201ENST00000410070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.17■■■■■ 4.34
RIMKLA-201ENST00000410070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
RIMKLA-201ENST00000410070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
RIMKLA-201ENST00000410070 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
RIMKLA-201ENST00000410070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
RIMKLA-201ENST00000410070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
RIMKLA-201ENST00000410070 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
RIMKLA-201ENST00000410070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
RIMKLA-201ENST00000410070 ARHGEF11O15085 1522 aa41.86■■■■■ 4.29
RIMKLA-201ENST00000410070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.75■■■■■ 4.27
RIMKLA-201ENST00000410070 CHD1O14646 1710 aa41.71■■■■■ 4.27
RIMKLA-201ENST00000410070 SOGA1O94964 1423 aa41.7■■■■■ 4.27
RIMKLA-201ENST00000410070 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
RIMKLA-201ENST00000410070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.61■■■■■ 4.25
RIMKLA-201ENST00000410070 CUX1P39880 1505 aa41.59■■■■■ 4.25
RIMKLA-201ENST00000410070 WDR97A6NE52 1622 aa41.57■■■■■ 4.25
RIMKLA-201ENST00000410070 FBLN2P98095 1184 aa41.53■■■■■ 4.24
RIMKLA-201ENST00000410070 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.5■■■■■ 4.23
RIMKLA-201ENST00000410070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.47■■■■■ 4.23
RIMKLA-201ENST00000410070 ARAP1Q96P48 1450 aa41.47■■■■■ 4.23
RIMKLA-201ENST00000410070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
RIMKLA-201ENST00000410070 GRIN2BQ13224 1484 aa41.36■■■■■ 4.21
RIMKLA-201ENST00000410070 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.35■■■■■ 4.21
RIMKLA-201ENST00000410070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
RIMKLA-201ENST00000410070 SYNJ2O15056 1496 aa41.25■■■■■ 4.19
RIMKLA-201ENST00000410070 SYNJ1O43426 1573 aa41.21■■■■■ 4.19
RIMKLA-201ENST00000410070 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.19■■■■■ 4.18
RIMKLA-201ENST00000410070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.18■■■■■ 4.18
RIMKLA-201ENST00000410070 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
RIMKLA-201ENST00000410070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.12■■■■■ 4.17
RIMKLA-201ENST00000410070 PBRM1Q86U86 1689 aa41.11■■■■■ 4.17
RIMKLA-201ENST00000410070 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
RIMKLA-201ENST00000410070 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.14
RIMKLA-201ENST00000410070 TOP2BQ02880 1626 aa40.89■■■■■ 4.14
RIMKLA-201ENST00000410070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.88■■■■■ 4.13
RIMKLA-201ENST00000410070 GRIN2AQ12879 1464 aa40.83■■■■■ 4.13
RIMKLA-201ENST00000410070 ADAMTS12P58397 1594 aa40.78■■■■■ 4.12
RIMKLA-201ENST00000410070 NUP160Q12769 1436 aa40.76■■■■■ 4.12
RIMKLA-201ENST00000410070 CEP170Q5SW79 1584 aa40.69■■■■■ 4.11
RIMKLA-201ENST00000410070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.68■■■■■ 4.1
RIMKLA-201ENST00000410070 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.67■■■■■ 4.1
RIMKLA-201ENST00000410070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.65■■■■■ 4.1
RIMKLA-201ENST00000410070 SHROOM2Q13796 1616 aa40.57■■■■■ 4.09
RIMKLA-201ENST00000410070 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
RIMKLA-201ENST00000410070 JPH4Q96JJ6 628 aa40.29■■■■■ 4.04
RIMKLA-201ENST00000410070 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.21■■■■■ 4.03
RIMKLA-201ENST00000410070 IGF1RP08069 1367 aa40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms