RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442616.1

POLR3H-208, Transcript of RNA polymerase III subunit H, human

TSL 5

Gene POLR3H, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR3H-208	ENST00000442616	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		60.05	■■■■■ 7.2
POLR3H-208	ENST00000442616	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.52	■■■■■ 6.16
POLR3H-208	ENST00000442616	ABCC9	O60706	1549 aa		53.18	■■■■■ 6.1
POLR3H-208	ENST00000442616	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.74	■■■■■ 5.71
POLR3H-208	ENST00000442616	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		50.65	■■■■■ 5.7
POLR3H-208	ENST00000442616	NACAD	O15069	1562 aa		50.52	■■■■■ 5.68
POLR3H-208	ENST00000442616	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.95	■■■■■ 5.59
POLR3H-208	ENST00000442616	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.89	■■■■■ 5.58
POLR3H-208	ENST00000442616	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.67	■■■■■ 5.54
POLR3H-208	ENST00000442616	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.55	■■■■■ 5.52
POLR3H-208	ENST00000442616	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.55	■■■■■ 5.52
POLR3H-208	ENST00000442616	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.38	■■■■■ 5.5
POLR3H-208	ENST00000442616	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.25	■■■■■ 5.47
POLR3H-208	ENST00000442616	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.98	■■■■■ 5.43
POLR3H-208	ENST00000442616	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.55	■■■■■ 5.36
POLR3H-208	ENST00000442616	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.02	■■■■■ 5.28
POLR3H-208	ENST00000442616	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.99	■■■■■ 5.27
POLR3H-208	ENST00000442616	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.8	■■■■■ 5.24
POLR3H-208	ENST00000442616	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.71	■■■■■ 5.07
POLR3H-208	ENST00000442616	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.66	■■■■■ 5.06
POLR3H-208	ENST00000442616	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.65	■■■■■ 5.06
POLR3H-208	ENST00000442616	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.56	■■■■■ 5.04
POLR3H-208	ENST00000442616	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.5	■■■■■ 5.03
POLR3H-208	ENST00000442616	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.34	■■■■■ 5.01
POLR3H-208	ENST00000442616	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		46.32	■■■■■ 5.01
POLR3H-208	ENST00000442616	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	46.24	■■■■■ 4.99
POLR3H-208	ENST00000442616	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		46.19	■■■■■ 4.99
POLR3H-208	ENST00000442616	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.87	■■■■■ 4.93
POLR3H-208	ENST00000442616	NES	P48681	1621 aa		45.84	■■■■■ 4.93
POLR3H-208	ENST00000442616	WIZ	O95785	1651 aa		45.78	■■■■■ 4.92
POLR3H-208	ENST00000442616	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.58	■■■■■ 4.89
POLR3H-208	ENST00000442616	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.49	■■■■■ 4.87
POLR3H-208	ENST00000442616	CUX2	O14529	1486 aa		45.49	■■■■■ 4.87
POLR3H-208	ENST00000442616	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		45.32	■■■■■ 4.84
POLR3H-208	ENST00000442616	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.27	■■■■■ 4.84
POLR3H-208	ENST00000442616	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.22	■■■■■ 4.83
POLR3H-208	ENST00000442616	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.18	■■■■■ 4.82
POLR3H-208	ENST00000442616	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.16	■■■■■ 4.82
POLR3H-208	ENST00000442616	CFTR	P13569	1480 aa		44.9	■■■■■ 4.78
POLR3H-208	ENST00000442616	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.85	■■■■■ 4.77
POLR3H-208	ENST00000442616	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.85	■■■■■ 4.77
POLR3H-208	ENST00000442616	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.82	■■■■■ 4.77
POLR3H-208	ENST00000442616	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.8	■■■■■ 4.76
POLR3H-208	ENST00000442616	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.75	■■■■■ 4.75
POLR3H-208	ENST00000442616	WDR62	O43379	1518 aa		44.69	■■■■■ 4.74
POLR3H-208	ENST00000442616	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.4	■■■■■ 4.7
POLR3H-208	ENST00000442616	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.38	■■■■■ 4.69
POLR3H-208	ENST00000442616	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.14	■■■■■ 4.66
POLR3H-208	ENST00000442616	TOPBP1	Q92547	1522 aa		44.02	■■■■■ 4.64
POLR3H-208	ENST00000442616	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.88	■■■■■ 4.62
POLR3H-208	ENST00000442616	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.88	■■■■■ 4.61
POLR3H-208	ENST00000442616	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.87	■■■■■ 4.61
POLR3H-208	ENST00000442616	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.8	■■■■■ 4.6
POLR3H-208	ENST00000442616	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.62	■■■■■ 4.57
POLR3H-208	ENST00000442616	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.57	■■■■■ 4.57
POLR3H-208	ENST00000442616	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.53	■■■■■ 4.56
POLR3H-208	ENST00000442616	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.53	■■■■■ 4.56
POLR3H-208	ENST00000442616	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.51	■■■■■ 4.56
POLR3H-208	ENST00000442616	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.49	■■■■■ 4.55
POLR3H-208	ENST00000442616	CUX1	P39880	1505 aa		43.48	■■■■■ 4.55
POLR3H-208	ENST00000442616	SOGA1	O94964	1423 aa		43.45	■■■■■ 4.55
POLR3H-208	ENST00000442616	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.44	■■■■■ 4.54
POLR3H-208	ENST00000442616	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.33	■■■■■ 4.53
POLR3H-208	ENST00000442616	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.28	■■■■■ 4.52
POLR3H-208	ENST00000442616	FBLN2	P98095	1184 aa		43.17	■■■■■ 4.5
POLR3H-208	ENST00000442616	CHD1	O14646	1710 aa		43.06	■■■■■ 4.48
POLR3H-208	ENST00000442616	WDR97	A6NE52	1622 aa		43.05	■■■■■ 4.48
POLR3H-208	ENST00000442616	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.05	■■■■■ 4.48
POLR3H-208	ENST00000442616	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.99	■■■■■ 4.47
POLR3H-208	ENST00000442616	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.97	■■■■■ 4.47
POLR3H-208	ENST00000442616	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.94	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.92	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.91	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.9	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.9	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.9	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.89	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.46
POLR3H-208	ENST00000442616	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
POLR3H-208	ENST00000442616	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.86	■■■■■ 4.45
POLR3H-208	ENST00000442616	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.85	■■■■■ 4.45
POLR3H-208	ENST00000442616	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.79	■■■■■ 4.44
POLR3H-208	ENST00000442616	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.79	■■■■■ 4.44
POLR3H-208	ENST00000442616	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.75	■■■■■ 4.43
POLR3H-208	ENST00000442616	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.59	■■■■■ 4.41
POLR3H-208	ENST00000442616	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.59	■■■■■ 4.41
POLR3H-208	ENST00000442616	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.49	■■■■■ 4.39
POLR3H-208	ENST00000442616	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.47	■■■■■ 4.39
POLR3H-208	ENST00000442616	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.43	■■■■■ 4.38
POLR3H-208	ENST00000442616	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.38	■■■■■ 4.38
POLR3H-208	ENST00000442616	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.38	■■■■■ 4.37
POLR3H-208	ENST00000442616	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.25	■■■■■ 4.35
POLR3H-208	ENST00000442616	NUP160	Q12769	1436 aa		42.24	■■■■■ 4.35
POLR3H-208	ENST00000442616	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.12	■■■■■ 4.33
POLR3H-208	ENST00000442616	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.05	■■■■■ 4.32
POLR3H-208	ENST00000442616	IGF1R	P08069	1367 aa		42.05	■■■■■ 4.32
POLR3H-208	ENST00000442616	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
POLR3H-208	ENST00000442616	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.93	■■■■■ 4.3
POLR3H-208	ENST00000442616	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.87	■■■■■ 4.29
POLR3H-208	ENST00000442616	CUL7	Q14999	1698 aa		41.86	■■■■■ 4.29

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