Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms