Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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