Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPGP40121 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPGP40121 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPGP40121 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CAPGP40121 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms