Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TGFBR1P36897 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms