Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CNBD2Q96M20 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms