Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFXN4Q6P4A7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFXN4Q6P4A7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms