Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS25P62851 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS25P62851 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS25P62851 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS25P62851 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS25P62851 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms