Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC47.05■■■■■ 5.12
LAMC3Q9Y6N6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
LAMC3Q9Y6N6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
LAMC3Q9Y6N6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
LAMC3Q9Y6N6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
LAMC3Q9Y6N6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
LAMC3Q9Y6N6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.98■■■■■ 5.11
LAMC3Q9Y6N6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
LAMC3Q9Y6N6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
LAMC3Q9Y6N6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
LAMC3Q9Y6N6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
LAMC3Q9Y6N6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
LAMC3Q9Y6N6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
LAMC3Q9Y6N6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC46.92■■■■■ 5.1
LAMC3Q9Y6N6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
LAMC3Q9Y6N6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
LAMC3Q9Y6N6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
LAMC3Q9Y6N6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
LAMC3Q9Y6N6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
LAMC3Q9Y6N6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
LAMC3Q9Y6N6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
LAMC3Q9Y6N6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
LAMC3Q9Y6N6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
LAMC3Q9Y6N6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.08
LAMC3Q9Y6N6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
LAMC3Q9Y6N6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
LAMC3Q9Y6N6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
LAMC3Q9Y6N6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
LAMC3Q9Y6N6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC46.58■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC46.57■■■■■ 5.05
LAMC3Q9Y6N6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC46.55■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC46.55■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC46.52■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
LAMC3Q9Y6N6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC46.49■■■■■ 5.03
LAMC3Q9Y6N6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
LAMC3Q9Y6N6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
LAMC3Q9Y6N6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
LAMC3Q9Y6N6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
LAMC3Q9Y6N6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
LAMC3Q9Y6N6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
LAMC3Q9Y6N6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
LAMC3Q9Y6N6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC46.31■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC46.27■■■■■ 5
LAMC3Q9Y6N6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms