Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POMPQ9Y244 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POMPQ9Y244 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POMPQ9Y244 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POMPQ9Y244 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
POMPQ9Y244 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms